4. Аминокислоты как физические операторы. Проблема соответствия
триплет - аминокислота
Для того, чтобы белок мог правильно воссоздать закодированную триплетами структуру графа необходимо, чтобы между кодирующим
триплетом и боковой цепью белка существовало определенное
соответствие
[17-19]. В этом разделе мы
рассмотрим вопрос о том, как оно может быть создано. При этом мы исходим из
того, что процесс самоорганизации вторичной структуры белка происходит
одновременно с его синтезом, т.е. ко-трансляционно. На это имеются многочисленные указания,
рассмотренные в монографии [8]. Как и в предыдущих разделах, в последующем
изложении (раздел 4.1.)в
качестве элементарного объекта в нашем анализе выступает 4х-звенный фрагмент белка (пентафрагмент).